Problemas com alinhamento da Layer

Olá pessoal, estou com um pegueno probleminha, estou inserindo uma Layer no site porem essa layer não fica no local onde deveria estar.Por exemplo eu alinho ela no devido lugar e testo a pagina na Resolução 800x600 ai fica ok, porem quando eu coloco essa mesma pagina numa resolução de 1024x768 essa layer vai parar em outro lugar.Já tentei mexer nas cordenadas X e Y mas não adianta se eu ajusto pra 1024 em 800 x600 ela sai fora.Por acasso existe um jeito de "colar" essa layer num só lugar.... pq esse probleminha já está me deixando de cabelo em pé.Muito Obrigado