Melhor forma de mixar o layout e o conteúdo

Olá, pessoal!Qual seria o melhor modo de mixar o layout e o conteúdo de um site? O topo, o menu e o rodapé geralmente repetem-se em todas as páginas sem repetições. Qual seria então o melhor modo de usá-los?Temos os includes, daí em todas as páginas devemos fazer uma referência ao arquivo(s) CSS, ao javascript, montar o XHTML básico e colocar os includes.Temos tb o layout fixo com o include do conteúdo. Seria uma página só com o conteúdo, que recebe a página destino pela URL e inclui esta página.Qual métodos vocês utilizam, e qual acham o melhor?