Segurança em PHP

Galera eu estou começando a programar em PHP e estou desenvolvendo um sisteminha simples para o gerenciamento de uma clinica odontológica...No meio do processo de desenvolvimento (e aprendizado) me deparei com uma dúvida... O PHP é uma linguagem server side que rotona só os codigos HTML quando um host requisita uma pagina ao servidor, então o código PHP não pode ser exibido com o comando "exibir código fonte" do navegador.Até ai tudo bem mas....Estou fazendo um sistema para ser rodado em um computador da própria clinica, para que o sistema não dependesse do acesso a internet para funcionar. Então o próprio computador do usuário seria ao mesmo tempo cliente e servidor. Mas se alguem tem acesso ao servidor, não vai também ter acesso ao código do meu sistema?Não há nada que eu possa fazer para impedir isso?tem algum jeito de fazer com que os arquivos PHP possam ser executados no servidor mas que ninguem possa abri-los sem uma senha ou coisa do tipo?