DOS nao esta funcionando bem no server 2003

Olaaqui na nossa rede ,possuimos por enquanto um sistema DOS rodando no server 2003,ja esta sendo feito o projeto do novo sistema em .NET,mas enquanto isso precisamos que o DOs continue funcionando bem,mas percebemos que ele tem estado muito lento;Gostaria de saber o que pode ser que esta causando essa lentidao no DOS ,alem da incopatibilidade gritante...