[Resolvido] Boas práticas

Olá estou iniciando na programação de gostaria de um dica de quem faz isso a muito tempo, eu sempre separo meus arquivos por pastas (mania de organização)tipo assim:

• img
• css
• js
• config
• biblioteca
• adm

isso cria muitas pastas mais em contra partida facilita muito meu trabalho para aprender; Só queria saber de vocês se o script fica mais lento por isso ou e quase irrelevante? já quero começar a programar certinho sem vícios.

;)