Erro misterioso

Ola.

Estou tendo um problema de 7 cabeças

Tenho uma classe Principal, que server de base para outras classes. Essa classe Principal possui uma função que executa querys, recebendo apenas a query a ser executada e permitindo exibir a query na tela se eu quiser.

Tenho uma outra classe chamada Listagem, que tem uma função que faz a listagem para gerar os options de um select.

Quando essa função executa, eu chamo através da query todos os componentes da tabela onde empresa = 1

SELECT campo FROM tabela WHERE empresa = 1

Quando eu executo essa query e escrevo na tela o mysql_num_rows, é indicado 177. Mas quando executo essa query diretamente na linha de comando de sql, eu tenho 200 linhas de retorno.

Ja vi e revi os script umas dez vezes, verifiquei a query, procurei por erros no script e até outros programadores me ajudaram mas ninguém conseguiu explicar porque quando eu executo a query pelo php, algumas linhas somem do conjunto de resultados

Será que alguém poderia me dar uma idéia?

Obrigado desde já.