PHP - Lógica de Programação - Editar Checkbox

HELP ME PLEASE - PHP LÓGICA :

Estou com o seguinte problema relacionado a check box:

Tenho 3 tabelas:

1- RAMOS (id, titulo, usuario);

2- RELACIONAR (id, id_empresa, id_ramos);

3- EMPRESAS (id, titulo);

Agora e o seguinte insiro as empresas na tabela EMPRESAS e tambem na RELACIONAR, a tabela RELACIONAR e para eu identificar quais RAMOS aquela EMPRESA trabalha. Por ex: CentralBorrachas - trabalha com pneus, ferramentas, parafusos, onde o id do pneu, ferramentas e parafusos ja estão inseridos na tabela relacionar (id_ramos) juntamente com o id da empresa (id_empresa).

Ate aqui blz, agora eu vou listar essas empresas para que eu possa editar as informações, o problema e o seguinte, quando eu vou editar uma empresa especifica eu quero que os CHECK BOX ja estejam marcados como checked, e não estou conseguindo fazer isso.

Para esclarecer mais:

Ao Clicar em editar Empresa quero listar todos os RAMOS da tabela RAMOS e deixar selecionado os ramos que ja pertencem a EMPRESA.