Funcionamento de uma aplicação compartilhada

Olá pessoal. Minha dúvida hoje é em relação à forma de uma aplicação que é compartilhada por vários usuários. Um exemplo é a própria conta aqui do fórum. A questão é que pretendo desenvolver um serviço para emissão e gerenciamento de nf-e com Rails e disponibilizá-la através de pagamentos mensais. Só que eis a questão. Como?

Crio a aplicação, mas e aí, como fazer para que todos os usuários possam utilizar o sistema? A cada novo cadastro aprovado eu criaria uma nova pasta no servidor contendo uma cópia do aplicativo e os locais corretos pra armazenar as notas fiscais? Desculpem se parece meio idiota a pergunta. Coisa de iniciante mesmo rsrs'