Organização de arquivos

Eai galera, estou estudando sobre OO, vi um tópico falando sobre design patterns e vi que muitos falam isso: "uma única instância para toda a aplicação", mas como isso funciona exatamente?

Exemplo:

- tenho vários arquivos no meu sistema:

index.php
single.php
header.php
comment.php
login.php
arquivo1.php

vamos dizer que eu precise da instância dessa classe em todos os arquivos, como seria isso?
tenho que incluir o arquvio da classe em todos os outros arquivos? autoloads? qual a melhor forma de fazer isso?

Agradeço a atenção!