Diferença entre "$(function(){ })" e "func

Minha pergunta deve ser imbecil, mas é que estou começando agora a mexer com js. Pois bem, qual é a diferença entre declarar uma função assim:

$(function minhaFuncao() { //codigo
}). 

E assim:

function minhaFuncao() { //codigo
}. 

Em um arquivo Js.