Problema controle de versão multiplos projetos

Bom dia galera, tudo bem?

Veja meu cenário, tenho um estrutura assim:

EMPRESA_X/

- Interface/

- Projeto_RH_Interface/

- Projeto_Secretaria_Interface/

- Projeto_Testouraria_Interface/

- Negócio/

- Projeto_RH_Negocio/

- Projeto_Secretaria_Negocio/

- Projeto_Testouraria_Negocio/

- System/

- DLL's dos projetos acima!!

Eu preciso colocar essa estrutura usando controle de versão GIT.

A principio eu criei os repositorio para cada projeto da Interface e Negocio, mas parece não ser o correto!!

Gostaria da experiencia de vocês para me ajudar a "arrumar" essa solução!!!