Converter vídeo de um formato para MP4

Qual o comando o FFMPEG pra converter vídeo de algum formato para MP4 ?

pesquisei, só achei de FLV.

To criando um Player de vídeo mais só roda vídeos em MP4 e to usando a linguagem PHP e já tenho o FFMPEG instalado no meu VPS.

Se alguém poder postar uma function eu fico grato.