Include

Boa tarde galera.

Estou com um problema com includes.

É o seguinte, fiz um site com topo, menu, conteudo e rodapé.

No topo, no menu e no rodapé eu faço include de arquivos separados, e no conteudo eu acrescento de cada pagina.

Mas ai está o problema, se eu colocar um <form></form> no conteudo, quando dou um F5 na página, o topo e o menu se desloca pra baixo, não sei o pq acontece isso.

E se eu tiro os includes e coloco os códigos direto na página, ai fica tudo resolvido.

Alguém sabe o porque isso acontece?