Exportar Excel com conteúdo JQUERY

Bom dia galera.

Seguinte, estou tentando exportar uma página, onde tenho conteúdo php e algumas contas com JQUERY.

Quando faço a exportação, o arquivo só traz os valores do php, e o JQUERY não realiza as operações, como se não estivesse carregando.

Estou utilizando a opção php:

header("Content-type: application/vnd.ms-excel");
header("Content-type: application/force-download");
header("Content-Disposition: attachment; filename=Relatorio_faturamento_regiao.xls");
header("Pragma: no-cache");

Agora não sei se ele aceita scripts javascript/jquery.

Alguém já fez alguma aplicação parecida?