Erro na codificação ao incluir arquivos

Boa tarde a todos,

Estou com um problema que está me perseguindo. Eu iniciei um projeto em um PC com windows. Fiz a parte de layout e criei páginas a serem incluidas(topo, menu, rodapé).

Porém, ao mudar meu projeto pro ubuntu, quando abri o arquivo fonte a primeira vez, as palavras que eram acentuadas todas ficaram com aquele caracter de interrogação (no código fonte x.x).

Primeiro eu apaguei as interrogações e aparentemente corrigiu mas, quando eu abro o site pelo meu localhost, somente os acentos que estão contidos no index.php aparecem, outros acentos (como o topo que é incluido no index) ficam com o sinal de interrogação. To usando o utf8 no meta do html, e nenhum desses arquivos está puxando nada do banco de dados ainda rsr.

O que pode ser?