Como fazer pagamentos via PHP ?

Sei que alguns alguns serviços de pagamento online tem uma API em PHP para confirmar pagamentos feitos pelo usuário. Esses mesmos serviços permitem executar um pagamento através do PHP ? Por exemplo, quando der 12:00h o sistema consulta o banco de dados e faz um pagamento de um determinado valor para uma determinada pessoa. Existe alguma forma de fazer isso ?