Enviar Remessa de boletos da loja virtual

Olá meus colegas me deparei com uma dúvida não sei se é o local certo do fórum, mas vamos lá, agora os bancos exigem que envie remessas de boletos gerados, mas e quanto a loja virtual como é enviado essa remessa se o cliente pode gerar o boleto na hora e pagar, sendo que o arquivo de remessa tem que ser enviado antes do cliente pagar o boleto?