Inserir dados no Banco

Olá pessoal, acredito estar no lugar certo, seguinte: Tenho em uma pagina php que lê um arquivo .csv, em média 3.000 linhas e inseri os dados no MySQL. Leva mais ou menos 1 minuto para adicionar esses dados, porém neste 1 minuto não consigo mais usar o sistema, mesmo em outro dispositivo, ou acessar o banco para fazer um login no sistema por exemplo. Isso é normal? Estou fazendo algo errado? Fui claro? Obrigado pela atenção.