Sistema com vários bancos de dados

Olá pessoal ,

Tenho um sistema no qual quero disponibilizar para varias empresas, porem quero separar os dados criando um banco de dados para cada empresa, mas não sei com fazer essa interação dinamicamente,  eu uso nos meus projetos um arquivo config.inc.php contendo  a conexão e um auto load com as pastas contendo as class.

No primeiro banco de dados  criei os acessos de usurário ligados a sua determinada empresa, ate ai tudo bem , porem uma vez o usuário logado como lido com essa situação, o usuário da empresa X deve gravar e consulte os dados do seu determinado banco e o usuário da empresa Y a mesma coisa .

Minha limitação esta sendo com o arquivo config imaginei de criar um para cada empresa apontando para seu determinado banco mas assim não deu certo .